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一、培养目的不同
会计学硕士主要以培养具备科研能力的人为主。
会计硕士培养目的是系统掌握现代会计理论与实务以及相关领域的知识和技能，具备会计工作领导能力的高素质会计人才。
二、招生对象不同
会计学硕士招生对象主要包括学历的本科应届毕业生，或具有的大学本科毕业学历的人员，或获得的大专毕业学历后经两年或两年以上(从大专毕业到下一年的九月)，达到与大学本科毕业生同等学力的考生(各校对专科生考生可能提出其他具体的业务要求)。
会计硕士专业学位招生对象为具有国民教育系列大学本科毕业(一般应具有学士学位)且从事会计或相关领域实际工作两年以上者。
三、课程设置不同
会计学硕士作为学历教育，重点是基础教育、素质教育和专业教育，偏重理论知识的掌握和学习，如财务理论、会计理论、审计理论、国际会计等会计相关知识。
会计硕士作为职业教育，则更多偏重于实务，学习的目的是为了解决实际工作中的问题。
四、学习方式不同
会计学硕士，一般要求全日职学习(在职人员当然也可以选择在职学习)，学习期间可以调转档案、人事、工资、户口等关系，学校管理较为严格。
会计硕士不同于一般意义上的会计学硕士学历教育。
会计硕士作为学位教育，全部面向在职人员，学习期间，一边工作一边学习，档案、人事、工资、户口等关系也不需要调转。
五、培养方式不同
会计学硕士侧重理论教学，过老师授课，个人课后理解并消化知识体系为主。会计学硕士的课程则一般是以理论为基础，包括财务会计原理和管理会计研究方法论等课程，整体要求学生在理论层面上有所，鼓励学生参与课题研究、发表论文等，为此特意在每学期都安排了各种课题。
在导师方面，会计学硕士只有一个校内导师负责科研和论文指导。会计学硕士则是以公费和委托培养方式为主，自费情况较少，并设置大量的奖学金。
会计硕士侧重实务实践，在教学上偏向研讨形式，以小组为单位进行研讨学习，课程体系中包含了很多实务研讨课，关于实践工作中的热点问题的解读课程也很多，比如财务与会计实务问题研讨、基于财务视角的银行信用风险管理以及纳税筹划等，对以后的工作实践具有很大的指导性。
在导师方面，会计硕士实行校内校外双导师联合培养制度，每一名会计硕士的学生都会配有一内导师和一外导师，分别负责学生的学术方面和社会实习方面。通常来讲，校外导师来自于各个领域，包括会计师事务所的高级经理人，大型国企的财务部门主管和一些企业的财务总监，这些校外导师根据学校的要求在每个假期安排学生实习、参观等社会实践活动。会计硕士一般都采取自筹方式培养，上学期间奖学金偏少。
六、职业认证不同
国际上的一些注册会计师协会会给予会计硕士一定的优惠政策。例如，被称为国际会计行业的黄金证照ACCA(英国特许会计师协会)给予会计硕士毕业生免考14门课程中的9门的优惠政策。
另外，CIMA(英国特许管理会计师公会的香港会计师公会)对MPAcc有快速通道免考协议。该快速通道免试政策主要面向MPAcc毕业生和顺利完成年学习的在校生。申请人凭学位证书或学校出具的年课程学习的证明即可参加快速通道考试。考试者即可获得CIMA管理会计高级文凭，CIMA职业资格11门课程的部分课程免考和豁免部分考试费用。
会计学硕士则没有相关的社会认证。
七、实习要求不同
对于会计学硕士来说，实习是要的，但是并没有强制要求，也没有校外导师提供便利的机会，大部分都是靠自己应聘得到的机会。
会计硕士对实习更加注重。会计硕士的培养方案中特意安排了实习学分作为考核要求，而且所占比重颇大。因为会计硕士是两年制，时间相对紧张，很多学生会选择在寒暑假完成实习。其中大多数实习机会是由上文所提到的校外导师提供的，另外一部分是学生过社会招聘方式自己应聘的。
作为会计硕士的学生，一般实习首先会选择一些投资银行、咨询公司和四大会计师事务所等，另外，也可以考虑一些内资银行和大型企业。一般而言，以普华永道为首的会计师事务所和外企都会选择在每年的6月、9月分别开始暑假和寒假的实习招聘而更有吸引力的外资银行和投资银行，例如摩根士丹利或者中信证券投资都会提前一年进行实习招聘。
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